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在乳腺癌分子亚型中探索基因集与预后的关联关系

作者:文章来源:所内发布时间:2016/7/19 0:00:00

近日,我所周宏灏院士课题组刘荣博士在《Oncotarget》杂志正式发表了一篇名为 《Gene modules associated with breast cancer distant metastasis-free survival in the PAM50 molecular subtypes》的文章。

乳腺癌为女性常见恶性肿瘤,目前该疾病的分子靶向治疗主要针对人表皮生长因子受体2(Her2)扩增型患者使用Her2阻断剂,而在其他分子亚型中可尝试采用何种分子靶向治疗仍不清楚。因此,研究旨在在乳腺癌PAM50分子亚型中探索是否有不同癌症相关、且能够被药物靶向调控的信号通路与患者的无远处转移生存率相关。

该项研究使用了从GEO上下载的14套乳腺癌相关数据(2027个样本),考察从文献中整理到的21个用于描述癌症相关的生物学过程、通路和已发表的用于预测乳腺癌预后的基因集合与乳腺癌无远处转移生存率之间的关联关系,研究发现在不同分子亚型(Basal-like, Luminal A, Luminal B,Her2+)中有不同的基因集的表达与预后显著相关。在Lum A型中,E2F3, PTEN loss通路和GGI基因集与预后显著相关;在Lum B型中,RAS通路与预后显著相关。其后本研究在不同分子亚型中分别鉴定了能较好预测预后的基因集合。其中Basal-like型患者预后预测基因集合主要参与免疫过程,进一步证实该类乳腺癌亚型可以尝试免疫疗法。

原文链接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26934123


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