基因表达和甲基化谱鉴定CXCL3和CXCL8是结肠腺癌诊断和预后的关键基因

近日，我所唐洁副研究员课题组在《JOURNAL OF CELLULAR PHYSIOLOGY》杂志上发表一篇名为“Gene expression and methylation profiles identified CXCL3 and CXCL8 as key genes for diagnosis and prognosis of colon adenocarcinoma”的文章。

结肠腺癌（COAD）是常见的恶性胃肠道肿瘤，在世界范围内发病率和死亡率都很高，并且预后不佳。研究结肠癌诊断和预后标志物是必要的。

本研究的目的是探索结肠癌关键基因，作为诊断和预后COAD的潜在的生物标志物。通过R语言对基因表达谱（GSE44076和GSE44861）和基因甲基化谱（GSE29490）进行分析，筛选异常甲基化和差异表达的基因。通过GO和KEGG进行功能富集，PPI网络筛选Hub基因，通过模块分析和生存分析筛选关键基因。最后，RT-qPCR验证筛选得到的关键基因。

基于以上，我们的研究发现CXCL3和CXCL8是COAD中两个低甲基化高表达基因，同时，这两个基因的低表达与COAD患者生存率低有关，也就是说，CXCL3和CXCL8可能是COAD诊断和预后的潜在生物标志物。

原文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/jcp.29368